基本上，精省工程就國家推動「組織改造」而言，至少有下列三項重要經驗可供嗣後從事組改工程的參考： 第一、組改前須制定完整的法依據 精省條例本身的條文雖不多，因採骨骼式立法，得以授權行政院發布法規命令，致使法依據不僅周延性相對提高，亦符合組改須依「組織保留原則」行事之法治原則，自然改制效能高。然而行政院此次組改，卻將原應由行政院會同立法院修法的提案權排除，以致發生目前立法委員亦得提案修改行政組織的立法紛擾，已將「組織保留」的法治原則破壞殆盡。 第二、組改須同步施行同時推動 由於政府組織須依法行政，而依法行政所涉法制殊多，如不能同步施行，同時推動，必然肇致法制不彰。因之，組改在相關法制上，應務求同步施行、同時推動。精省所以能在1999年7月1日推動，即因精省條例之授權，行政院可在相關法制未完成修正立法前，即以「法規命令」施行。嗣後再依法制發展需要，修改相關法制。行政院在本次組改過程中，卻未能於相關法制中有此類似規制，以致組改竟須完全聽命於立法院之法案修正。一旦立法怠惰，組改即無限期拖延。 第三、組改須在最短時間內同時完成 台灣省之精省時程，法有明定；即使延長，亦只能一次延長一年，俾時程接受立法院之監督，而不致行政怠惰。行政院此次組改即無此設計，以致本該在2012年1月1日同時啟動，卻權宜為可分多階段推動之組改，自然時間拉長。行政院各部會組改有前有後，難免令人有不知所措之困擾。